IntegraGen Genomics a développé une expertise particulière dans les analyses de méthylation par séquençage haut-débit : RRBS et Methyl-SEQ. Ces approches permettent aux chercheurs d’étudier les régions riches en marqueurs méthylés et d’éviter les approches coûteuses de séquençage complet de méthylome.

RRBS – Reduced Representation Bisulfite Sequencing

Le RRBS est une technique idéale pour analyser le profil de méthylation d’un échantillon par séquençage haut-débit. La technique est basée sur l’enrichissement des régions riches en CG du génome, permettant ainsi de réduire significative la quantité de séquence et le coût associé, tout en permettant une analyse exhaustive de la majorité des promoteurs et des régions génomiques d’intérêt.


Notre expérience

  •  Préparation de banque RRBS optimisée, basée sur le protocole de Meissner et al. *
  • Publications de nos clients disponibles sur des résultats d’études RRBS

 * Messner et al. Preparation of reduced representation bisulfite sequencing libraries for genome-scale DNA methylation profiling. Nature Protocols 2011; 6:468–481.


Ce qui fait de nous votre meilleur partenaire

  • Expertise dans le design de projets de recherche et mise en place de plan d’analyse
  • Protocoles RRBS optimisés pour l’homme et la souris
  • Digestion Msp1 ou double digestion (eRRBS)
  • Expertise en RRoxBS

Nous proposons également les services d’experts pour vous accompagner dans l’analyse biostatistique et l’interprétation  de vos données de méthylation via notre service de pointe GeCo (Advanced Genomics Consulting).


Garanties techniques

  • Taux de conversion >99,5%
  • Profondeur de séquences et couverture garanties, projet dépendante.

    Weber quote 3

 Analyse des données RRBS et Methyl-Seq

  • Analyse bioinformatique primaire des données avec le pipeline de référence BS-Seekerintegragen-genomics-geco
  • Le rendu standard inclut le taux de méthylation par cytosine dans les 3 contextes de séquences CG/CHG/CHH.
  • Analyse statistique avancée des données disponible avec notre service GeCo, Advanced Genomic Consulting Service.